Automatická analýza obrazů nervové tkáně ze světelné a elektronové mikroskopie

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P202-11-0111

Název projektu anglicky

Automatic analysis of light and electron microscopy neuronal data

Anotace anglicky

This project is a small part of an effort to obtain what is sometimes called the 'brain wiring diagram' - a detailed description of a part of the neural tissue, the sizes, shapes, types and positions the neurons in the tissue and especially their connectivity pattern, the geometry of the axons and dendrites, the size of the synapses and perhaps other parameters of interest. We plan to develop algorithms for the joint analysis of 3D light microscopy (mainly confocal microscopy and two-photonmicroscopy) and 3D electron microscopy (mainly a focused ion beamscanning electron microscopy, FIB/SEM), which will segment the 3Delectron microscopy images with the help of the light microscopy images, identifying and classifying the neurons and various other subcellular structures. We will also automatically trace the dendrites and axons, forming a tree and determining connectivity between the neurons. An important part of the project will be the development of technique for registering electron and light microscopy images.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

IN - Informatika

CEP - vedlejší obor

JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla dosažena řada kvalitních výsledků v oblasti automatického zpracování medicínských obrazů. Závěrečná karta uvádí adekvátní údaje. Do projektu byla zapojena řada doktorandů, projekt má značný aplikační potenciál v medicíně. Výstupy byly prezentovány ?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

18. 4. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 5. 2015

Celkové uznané náklady

4 444 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 444 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč