Strukturně-funkční vztahy haloalkan dehalogenas
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Hlavní účastníci
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta<br>Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
P207-12-0775
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Structure-functional Relationships of Haloalkane Dehalogenases
Anotace anglicky
Haloalkane dehalogenases (EC 3.8.1.5) are microbial enzymes with catalytic activity for hydrolytic conversion of xenobiotic and toxic halogenated aliphatic compounds to corresponding alcohols. Until now, only four tertiary structures of these enzymes have been solved by X-ray analysis. Structures of several novel enzymes crystallized by us will be solved and deposited to Protein Data Bank within the framework of this project. Additionally, recently cloned and biochemically characterized enzymes will be crystallized and structuraly characterized. Although the molecular structure of three haloalkane dehalogenases is known, some details of the reaction mechanism are not understood yet. Therefore, neutron diffraction will be used in parallel to X-ray diffraction to describe the role of hydrogens in water and protonated residues in the active site and access tunnels connecting the active site cavity. Structural data will be linked to the functional biochemical data leading to better understanding of structure-function relationships of haloalkane dehalogenases and related a/b-hydrolases.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CD - Makromolekulární chemie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
BO - Biofyzika
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10404 - Polymer science<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rámci projektu byly identifikovány a studovány nové typy dehalogenáz, schopných redukovat halogeny v organických látkách. Údaje řešitele jsou adekvátní. Výsledky jsou významné pro základní výzkum i pro možné aplikace v detoxikaci halogenovaných organických látek v životním prostředí. Dvacet článků v impaktovaných časopisech odpovídá velikosti kolektivu i multidisciplinaritě projektu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2012
Ukončení řešení
31. 12. 2016
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
21. 6. 2016
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
12 225 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
12 225 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč