Struktura a funkce senzorové domény proteinkinasy StkP eukaryotického typu a její vztah k buněčným procesům

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P207-12-1568

Název projektu anglicky

Structure and function of sensor domain of proteinkinase StkP and its relationship to cellular processes

Anotace anglicky

PknB-like protein kinases make up a distinct family of signaling proteins consisting of an intracellular kinase domain, a transmembrane span and repeated extracellular PASTA domains (penicillin-binding protein and Ser/Thr kinase associated domains). PASTA domains are found in penicillin-binding proteins (PBP) and their function was deduced from the crystal structure of pneumococcal PBP2X showing that PASTA domains bind the beta-lactam ring of the antibiotic cefuroxime. The beta-lactam ring resembles the D-Ala-D-Ala motif of the peptidoglycan stem peptide; therefore, kinases containing PASTA domains were proposed to sense unlinked peptidoglycan subunits. This project is aimed to solve 3D- structure of sensor domain of StkP kinase and to determine amino acid residues involved in ligand binding. Substitution of these amino acids by neutral residues will result in abolished binding affinity to the ligand molecules. Consequently, StkP-dependent signalling cascade will be blocked on the input. The effect of interruption of signal transduction on cellular function will be studied in detail.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu po třech letech neposkytlo dostatečný počet výstupů. Vytýčené cíle se v daném časovém horizontu nedařilo dostatečně plnit.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

S - Zastavený (předčasně ukončený) víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

31. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

30. 9. 2017

Celkové uznané náklady

4 374 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 374 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč