Jak Giardia intestinalis, jednobuněčný eukaryot se dvěma jádry a minimalistickým genomem, zajišťuje integritu chromozómů
Cíle projektu
Eukaryotické buňky disponují unikátními strukturami na chromozomech, jako jsou centromery a telomery, a mechanizmy, které zajišťují stabilitu genetické informace. Giardia intestinalis představuje, pro svou fylogenetickou pozici vzdálenou všem klasickým modelovým organizmům a přítomnost dvou jader v rámci jediné buňky, zajímavý model pro studium těchto mechanizmů. Předkládaný projekt se zaměřuje především na (1) chromozomy a význam jejich organizace pro uchování genetického materiálu; (2) kontrolní body monitorující stav DNA v průběhu buněčného cyklu. Techniky fluorescenční in situ hybridizace, transfektanti Giardia exprimující značené studované proteiny či skenovací a transmisní elektronová mikroskopie budou využity za účelem studia charakteru buněčné výbavy G. intestinalis. Společně s daty z jiných organizmů umožní prohloubit pochopení klíčových kontrolních mechanismů v eukaryotické buňce.
Klíčová slova
chromosomestelomerecentromerekinetochoreGiardiacellcyclecelldifferentiation
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
P305-12-1248
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Maintenance of chromosome integrity in Giardia intestinalis, a unicellular bi-nucleated eukaryote with minimalistic genome
Anotace anglicky
Eukaryotic cells possess unique chromosomal structures and mechanisms maintaining the stability of genetic information such as centromeres, telomeres and cell cycle checkpoints. Giardia intestinalis represents a novel model organism for studies of such mechanisms due to distant phylogenetic position to all common model organisms and the presence of two nuclei within a single cell. The main focus of the proposed project deals with (1) chromosomes and significance of their organization in respect to preservation of genetic material; (2) control points monitoring the state of DNA throughout the cell cycle. Fluorescence in situ hybridization techniques, production of Giardia transfectants expressing tagged proteins of interest, scanning and transmission electron microscopy, flow cytometry, immunoprecipitation and immunohistochemistry will be used to reveal the characteristics of equipment of Giardia cell and, together with data obtained from the other organisms, will allow us to deepen our insight into the key control mechanisms functioning in eukaryotic cell.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
EA - Morfologické obory a cytologie
CEP - další vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V průběhu této studie se podařilo úspěšně charakterizovat chromosomy Giardií pomocí mikroskopických technik, včetně vysokorezoluční skanovací elektronové mikroskopie a in situ hybridizace. Dosud byla publikována jedna práce (IF4,602), druhá publikace je v recenzním řízení (Cell Microbiol, IF4,915), přiložen je rukopis třetí publikace a krátkého sdělení před zasláním do redakce.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2012
Ukončení řešení
7. 12. 2015
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2015
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Datum dodání záznamu
25. 9. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
5 425 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
5 425 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
5 425 tis. Kč
Statní podpora
5 425 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2012 - 07. 12. 2015