Evoluce genomu alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) rozdílného fylogenetického stáří

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut<br>Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-10-1014

Název projektu anglicky

Genome evolution in Cardamine allopolyploids of contrasting phylogenetic age

Anotace anglicky

Polyploidy is playing a crucial role in speciation of spermatophytes. Nevertheless, surprisingly little is known about the chromosome stability in first generations following the polyploid origin and in recent polyploids. For the first time, the combined GISH/CCP technique (Genomic In Situ Hybridization/Comparative Chromosome Painting) will be applied to analyze inter-genomic chromosomal interactions in Cardamine hybrids and allopolyploids. GISH will identify parental chromosome complements and inter-genomic translocations, whereas CCP will pinpoint inter- and intra-chromosome rearrangements. The chromosome stability will be analyzed in the recent hybrid Cardamine ´ insueta (2n=24) and its autoallohexaploid derivative C. schulzii (2n=48) (both c. 100 years old), as compared to an old allotetraploid species C. flexuosa (2n=32). For the three taxa, synthetic lines will be established and the chromosome stability monitored in successive generations. Karyological variation will be related to phylogenetic relationships inferred from the analysis of nuclear and chloroplast markers.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Bylo potvrzeno, že Cardamine flexuosa je alotetraploid vzniklý hybridizací C.hirsuta x C.amara, byl potvrzen vznik hybridogenních populací. Výsledkem grantu jsou dvě publikace a metodická kapitola v knize. Hodnoceno vynikající.

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

15. 4. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:2

Datum dodání záznamu

30. 9. 2017

Celkové uznané náklady

6 743 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 743 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč