Přesné mapování a identifikace kandidátního genu ovlivňujícího dobu kvetení pšenice

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-10-1778

Název projektu anglicky

Fine Mapping and Candidate Gene Analysis of the Flowering Time Gene on Wheat

Anotace anglicky

Genes controlling flowering time in wheat (Vrn, Ppd, Eps) are of essential importance for optimizing adaptation and hence yield. A new flowering time gene QFt.cri-3B.1 was genetically mapped on the long arm of wheat chromosome 3B near the SSR marker Xbarc164 on Crop Research Institute. The present project proposal, targeted at more detailed analysis of this gene, includes fine mapping of the gene both genetically and physically and the identification of possible candidate genes, as a preliminary to cloning the gene and the study its function, as well as a more detailed phenotyping to study effects of the gene on wheat growth and development. Chromosome deletion lines will be used for chromosome 3B bin mapping; F2 populations developed from near-isogenic lines will be analysed for fine mapping; comparative mapping of the wheat genomic region containing the gene will be done with Brachypodium and rice. A local contig will be developed for the region of interest in cv. Chinese Spring using available physical map of chromosome 3B  and specific BAC resources. A BAC library specific for 3B of cv. Česká Přesívka will be developed and clones containing candidate genes will be identified and sequenced. The long-term goal of this project is the identificationof a candidate gene for QFt.cri-3B.1.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - další vedlejší obor

DO - Ochrana krajinných území

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl podrobně mapován zejména pomocí SNP márkerů lokus genu malého účinku QFt.cri-3B.1, který moduluje kvetení u pšenice, což umožní jeho následné klonování. S použitím získaných genotypů byly studovány mikrofenotypické charakteristiky působení uvedeného?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

7. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2014

Celkové uznané náklady

5 801 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 801 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč