Interakce genomů v mezidruhových hybridech xFestulolium

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-11-0504

Název projektu anglicky

Genome interactions in interspecific hybrids xFestulolium

Anotace anglicky

Polyploidy is a key force in the evolution of flowering plants. Allopolyploidy involves a merge of distanc genomes followed by whole-genome duplication. Recently formed allopolyploids retain duplicated copies of most genes on homoeologous chromosomes. However, it appears that the contribution of parentel genomes need not to be equal and that altered gene expression is common. Such a divergence is believed to develop in two phases. The first takes place immediately after the hybrid formation, the secondis a gradual evolution of gene expression mediated by diversification of duplicated genes. Here we propose to sequence transcriptome of two grass species (Festuca pratensis and Lolium multiflorum). The sequences will be used to design a Nimblegene chip,which will be used to analyze gene expression in three successive generations of newly synthesized Festuca × Lolium hybrids. This will provide novel data on genome interactions and silencing of genes belonging to the parental genomes. Moreover, komparative genomic hybridization will be used to identify the loss of particular gene loci as a consequence of the merge of two distinct genomes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Ihned po spojení genomů dochází ke změnám genové exprese, avšak pouze u malé části genů je jeden homeolog úplně umlčen. Vyvinuty jedinečné metodické přístupy a rostlinný materiál. Cíle splněny, pouze dodatečné výsledky však zveřejněny jako původní článe?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 5. 2015

Celkové uznané náklady

7 330 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 330 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč