Nové flavin-dependentní enzymy Paracoccus denitrificans: reakční mechanismy, metabolické funkce a úloha v buněčném oxidačním stresu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P503-12-0369

Název projektu anglicky

Novel flavin-dependent enzymes of Paracoccus denitrificans: reaction mechanisms, metabolic functions and their role in cellular oxidative stress

Anotace anglicky

The project deals with two enzymes, flavin reductase FerA and quinone reductase FerB, coupled with generation and/or managing oxidative stress in the bacterium Paracoccus denitrificans, often called “a free living mitochondrion”. The gene for the FerA will be isolated and the prepared corresponding recombinant protein will be characterized enzymologically, by X-ray crystallography and by site-directed mutagenesis. It will be determined whether FerA acts alone or in combination with other proteins. Production of superoxide by FerB will be quantified in in vitro experiments and the hypothesis will be tested that FerB is able to reduce the membrane bound ubiquinone. Wild-type strain and strains lacking or overproducing FerA and FerB will be compared for the degree of membrane lipid peroxidation. Proteomic analysis of cells exposed to redox stressors will help to identify redox regulon members.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem projektu bylo popsat krystalovou strukturu bakteriální flavinreduktasy FerA i v komplexu s FMN. Strukturní data spolu s výsledky studia enzymové kinetiky, vazby substrátů a řízené mutageneze objasňují molekulové mechanismy interakce FerA se substráty. Dále byly získány nové poznatky o funkci flavoenzymu FerB, bylo zjištěno, že FerB účinně odstraňuje superoxid mění ho na peroxid vodíku.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

25. 4. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 3. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

4 924 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 924 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč