Distribuce, fylo-geografie a vnitrodruhová ekologická diferenciace uvnitř klastru Limnohabitans a Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P504-10-0566

Název projektu anglicky

Distribution, phylogeography and within-taxon ecological differentiation of Limnohabitans cluster and Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus

Anotace anglicky

Frequently, bacterial diversity is expressed in operational taxonomic units defined by 97, 98 or 99% of 16S rRNA sequence similarities. However, the functional and genetic diversity within such groups is largely unknown. It is thus not clear if such taxonomic groups contain strains behaving similarly or occupying completely separated ecological niches. The proposed project should focus on two important groups of freshwater bacteria and reveal the genetic and functional diversity inherent within these groups. The two investigated groups are represented by the Limnohabitans cluster and Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus cluster (both Betaproteobacteria). Both groups of bacteria represent numerically and ecologically important groups in thefreshwater habitats. We aim on description of the distribution, phylogeography and genetic diversification of the two groups on the intra-specific level by means of designing specific probes targeted against different lineages and lineage groups as wellas by conducting ecological niche-separation lab experiments.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EH - Ekologie – společenstva

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt přinesl zajímavé výsledky o ekologii významných druhů bakterioplanktonu. Vzhledem k významu studovaných druhů to významně rozšiřuje poznatky o ekologii limnických systémů. Výstupem projektu jsou dvě publikace, jedna kvalitní, jedna vysoce kvalit?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-GA0-GA-U/02:3

Datum dodání záznamu

17. 5. 2016

Celkové uznané náklady

1 949 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 949 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč