Mezidruhová analýza rekombinantních nitrilas exprimovaných z hypotetických sekvencí, jejich význam a potenciální aplikace v životním prostředí

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P504-11-0394

Název projektu anglicky

Interspecies comparison of nitrilases by using recombinant enzymes obtained by database-mining: their environmental impact and potential application

Anotace anglicky

A large number of nitrilases were sequenced, but only a small part of them were examined for enzymatic function. The expression of about 25 synthetic genes coding for hypothetical nitrilases in fungi (primarily phytopathogenic species) and biochemical examination of the translation products will allow us to describe for the first time the function of these enzymes. We shall classify them into subgroups of differing substrate specificities and, on the basis of kinetic data, formulate hypotheses on the natural substrates of fungal nitrilases. Selected nitrilases differing in substrate specificities will be purified and characterized in terms of their catalytic and structural properties . We shall also express (in E. coli and Rhodococcus sp.) about five nitrilases from actinobacteria and compare their substrate specificity and structural properties with those of fungal nitrilases. We shall evaluate the ability of fungal and bacterial nitrilases to transform benzonitrile herbicides and propose microorganisms and enzymes suitable for elimination of these compounds. Expression of a representative set of nitrilase genes will allow us to conclude if the effect of chaperones on the production of functional nitrilases is general among nitrilases or case specific.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

1. Byla vytvořena knihovna nitriláz, optimalizována jejich produkce a objasněna jejich distribuce v přírodě. 2. Údaje řešitelky jsou adekvátní. 3. Výsledky použitelné v molekulární ekologii, environmentálních vědách, mikrobiologii. Podíl studentů na řeš?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

23. 4. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 5. 2015

Celkové uznané náklady

9 720 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 720 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč