Zjišťování historie speciace z populačních genomových dat: lekce od sekavců a slavíků

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P506-10-1155

Název projektu anglicky

Inferring the history of speciation from genome-wide population data: lessons from spined loaches and nightingales

Anotace anglicky

Introduction of next-generation sequencing technologies has opened a new era in population genetics, allowing for rapid and inexpensive collection of genome-wide sequence data even for non-model species. Here, we propose to use 454 sequencing to study history of speciation and patterns of hybridization in two non-model organisms: hybrid complex of spined loaches and two hybridizing species of nightingales. Both groups lay on opposite extremes of potential hybridization outcomes: while in nightingales the Mendelian hybrids mediate gene flow between the species, hybridization in spined loaches leads to asexuality. We will sequence cDNA from multiple somatic and germinal tissues from several individuals of each species. The obtained data will help us to understand several fundamental questions about speciation, including the role of sex chromosomes in reproductive isolation or the origin of sexual species from asexual hybrid lineages. Moreover, our data will enable us to identify candidate speciation genes, which can provide new insights into the genetic underpinnings of speciation. 

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EG - Zoologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Během řešení projektu byly publikovány celkem 4 vědecké práce, z nich 3 lze považovat za mimořádně kvalitní, neboť jejich IF přesahuje hodnotu 3.

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2014

Celkové uznané náklady

8 718 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 718 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč