Vznik sekundárního plastidu u euglenidů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P506-11-1320

Název projektu anglicky

Establishment of the secondary plastid in euglenids

Anotace anglicky

The project is focused on the secondary plastids of euglenids. We will perform environmental survey in order to reveal a green alga related to the ancestor of the euglenid plastid closer than the so far known Pyramimonas parkeae. Using 454 technique we will sequence the transcriptome (cDNA) of this alga or P. parkeae and three species of euglenids -  Eutreptiella gymnastica, Phacus caudatus a non-photosynthetic Rhabdomonas sp. Furthermore we will sequence the plastid genome of the alga and photosynthetic euglenids.  From the data we will reconstruct plastid proteomes and perform a comparative analysis including the well studied plastid of E. gracilis. We will notice the similarities and differences between genomes and proteomes of plastid established in three lineages of euglenids. We will be interested in the phylogenetic origin of proteins of euglenids, particularly in the contribution of proteins originating from the cyanobacteria (ancestor of the primary plastid) and the green alga (endosymbiot). The contributions will be compared between the euglenid lineages.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cíle projekty byly splněny a několik hypotéz o evoluční historii eukaryotických mikroorganismů mohlo být testováno. Konkrétními výstupy projektu jsou 4 články v časopisech s dobrým impakt faktorem. Projekt rovněž umožnil získání rozsáhlého souboru genomických dat pro další výzkum a aktivní zapojení studentů. Finance byly použity hospodárně.

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 5. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

25. 9. 2017

Celkové uznané náklady

7 892 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 892 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč