Sekvenace genomu oxymonády a trimastixe

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P506-12-1010

Název projektu anglicky

Genome sequencing of oxymonad and Trimastix

Anotace anglicky

The boom of the whole genome sequencing that we experience recently affects the diversity of eukaryotes very unevenly. The main attention is obviously paid to animals, fungi and plants. 372 out of 443 finished genomes listed in GenBank belong to these groups. The research in the last decade showed clearly that the main portion of the eukaryotic diversity at the level of cell structure and function lies in unicellular protists. In the proposal we would like to use the methods of next generation sequencing to obtain drafts of genomes of two flagellates of the group Preaxostyla - Monocercomonoides and Trimastix. Preaxostyla belong to the group of anaerobes called Metamonada together with parasites Trichomonas vaginalis and Giardia intestinalis. In contrary to markedly derived trichomonads and Giardia, the cells and genomes of Preaxostyla may resemble more closely the original state in the common ancestor of Metamonada. The information in their genomes will be interesting for the understanding of the cell biology of the ancestors of Metamonada and the first eukaryotes in general.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V rámci řešení projektu se podařilo získat, zpracovat a interpretovat poměrně velké množství nových genomických dat z evolučně významných modelů. Z hlediska získaných výsledků tedy projekt uspokojivě naplnil plánované cíle. Problematickým aspektem je však publikační aktivita - do podání závěrečné zprávy byla publikována pouze jedna práce. Další rukopisy jsou deklarované jako připravované.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

7. 4. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

5 845 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 845 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč