Polyploidie a krása - analýza komplexních genomů růží (Rosa L. sect. Caninae (DC.) Ser.)

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní projekty

Veřejná soutěž

Mezinárodní projekty 11 (SGA0201600003)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-02149J

Název projektu anglicky

Polyploidy generates beauty – exploration of complex genomes of roses (Rosa L. sect. Caninae (DC.) Ser.)

Anotace anglicky

Despite significant progress in our understanding of polyploid genomes many aspects of their evolution remain poorly understood. Rosa represents an ecologically important genus with widespread polyploidy. However, Rosa is also enigmatic in having a unique reproduction system called 'permanent odd polyploidy'. Here we propose to explore Rosa mitosis and meiosis using cytogenetic, molecular and genomic approaches. By using conventional rDNA and newly developed chromosome-specific FISH probes, we are going to follow the behaviour of genomes during meiosis in parental species and natural hybrids. Deep sequencing of Rosa genomes yielding large amount of genomic sequences will be useful for generation of genome and chromosome-specific probes. We expect that such an approach will allow us to obtain information about the major components constituting the chromosome sets which are characterised by their different meiotic behaviour.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem mezinárodního projektu bylo podrobně prostudovat specifický typ polyploidie spjatý s asymetrickou meiozou u planých růží. Řešitel a jeho zahraniční partner z Muzea v Gorlitz (Německo) se zaměřili zejména na výzkum role satelitů a také rDNA u růží. S tímto zaměřením projektu souvisí i dlouhodobější práce na údržbě a rozšiřování databáze rostlinné rDNA a B chromozomů.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GC-U/01:1

Datum dodání záznamu

27. 6. 2019

Celkové uznané náklady

4 428 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 233 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

195 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč