Dual RNA-seq analýza genové exprese v průběhu infekce lidských makrofágů baktériemi Bordetella pertussis

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní grantové projekty hodnocené na principu LEAD Agency

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

16-34825L

Název projektu anglicky

Transcriptomics of Bordetella pertussis and human phagocytes interplay

Anotace anglicky

Bordetella pertussis is the causative agent of human whooping cough, a highly contagious respiratory disease that is currently again on the rise even in highly vaccinated populations. B. pertussis has been traditionally viewed as a typical extracellular pathogen that colonizes ciliated respiratory epithelia. Recently, it was demonstrated that B. pertussis cells upon infection of human macrophages escape killing and persist in macrophages, suggesting that B. pertussis can be considered as a facultative intracellular pathogen. In order to further explore this observation we will apply parallel comparative transcriptomic analysis of gene expression profiles of human phagocytes infected by B. pertussis. Using this approach we plan to identify phagocyte-specific adaptation responses to the infection as well as specific responses of the pathogen cells in the process of adaptation to intracellular environment of phagocytes. This analysis should reveal novel virulence factors as well as assign new functions for already well-known virulence factors.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Závěrečné odborné hodnocení projektu provedla na principu LA partnerská agentura.

Zahájení řešení

30. 9. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GF-U

Datum dodání záznamu

28. 2. 2022

Celkové uznané náklady

6 942 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 942 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč