Vývoj NMR experimentů pevné fáze pomocí teorie optimálních procesů pro studium proteinů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní grantové projekty hodnocené na principu LEAD Agency

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

24-13437L

Název projektu anglicky

Development of Optimal Control derived experiments for biological MAS solid-state NMR

Anotace anglicky

This proposal is a follow-up application of a joint DFG-GAČR project carried out in 2020-2022 focused on solid-state NMR applied to the structure determination of biological solids like amyloid fibrils and membrane proteins that are still hampered by low sensitivity. Using optimal control methods, we developed phase-preserving coherence transfer experiments. This is a game-changing strategy that improves sensitivity by a factor of 1.41 for each indirectly sampled spectral dimension in multidimensional correlation experiments. In this project, we want to apply the same strategies to develop assignment methods that involve Cbeta chemical shifts, efficient methods for assigning methyl resonances that eliminate laborious mutagenesis approach, and to develop techniques for quantitative distance measurements used for structure determination. The potential impact of the project is enormous, as it will greatly facilitate the implementation and analysis of higher dimensional experiments required for the routine characterization of biomolecular structures by MAS solid-state NMR.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10301 - Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect)

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

BE - Teoretická fyzika

Zahájení řešení

1. 1. 2024

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GF-R

Datum dodání záznamu

16. 2. 2024

Celkové uznané náklady

6 033 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 033 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč