Charakterizace regionů meiotické rekombinace v pšenici seté

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Juniorské granty

Veřejná soutěž

Juniorské granty 2 (SGA0201600002)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-07155Y

Název projektu anglicky

Characterization of meiotic recombination regions in bread wheat

Anotace anglicky

Bread wheat is one of the most important crops in the world providing staple food for 40% of human population. Enrichment of its gene pool for genes from related species contributing to higher yield and resistance to biotic and abiotic stresses is an attractive strategy to ensure stable wheat production. However, meiotic recombination allowing alien gene transfer remains poorly understood. In wheat, it is under strong control of the Ph1 locus. Three mapping populations derived from crosses of line with T.militinae introgressions were created, including one with recessive Ph1 locus. Sequence characterization and high density mapping of a 15 Mb region in an introgressed segment on chromosome 4A and use of mapping populations differing significantly in recombination frequency in the region pose favourable means to study recombination at DNA level. We propose to characterize and compare recombination sites in the region at sequence and epigenetic levels to obtain new insights into meiotic recombination mechanisms and function of Ph1 locus in wheat.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena

Zhodnocení výsledků projektu

Vzhledem k předčasnému ukončení projektu na počátku r. 2017 se výsledky omezují na ty, které byly dosažené v prvním roce řešení. Byly zavedeny metody studia rekombinačních hot-spotů, tzv. "pollen typing" a digital droplet PCR z jaderné DNA pylových zrn. Byla anotována oblast zájmu včetně identifikace 502 genů a pseoudogenů.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

19. 1. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GJ-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

2 961 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 961 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč