Nový pohled na starou problematiku: role celogenomových procesů v adaptivní radiaci rostlin studovaná pomocí moderních sekvenačních technik

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Juniorské granty

Veřejná soutěž

Juniorské granty 2 (SGA0201600002)

Hlavní účastníci

Botanický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-15134Y

Název projektu anglicky

Old wine in new skin: the role of polyploidization and hybridization in an adaptively-radiated plant group using high-throughput sequencing methods

Anotace anglicky

The role of whole genome duplication and hybridization in adaptive radiation is controversial. The proposed research aims to test if both triggered adaptive radiation of Oxalis L., a speciose, morphologically and cytologically variable plant genus. This will be achieved by generation of phylogenetic hypotheses for the entire genus, based on hundreds of low-copy genes and whole plastid genomes, dating those phylogenies, differentiating between the role of polyploidization and hybridization in rapid speciation along the phylogeny by testing hypotheses of chromosome number evolution, the effect of ploidy on diversification rate, inferring paleopolyploidization events, detecting hybrids and testing for hybridization in the presence of deep coalescence, gene duplication and loss, and studying the role of polyploidization and reproductive isolation in population differentiation of a selected species of high ploidy diversity. Insights gained in such a comprehensive way are likely to be valid for a broad range of organisms and might represent general evolutionary mechanisms.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EF - Botanika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Juniorský projekt se věnoval zejména metodickému rozpracování fylogenomických postupů a jejich aplikaci na analýzu rodu Oxalis. U tohoto rodu byla dokumentována častá polyploidizace, avšak nikoliv hybridizace. Byly dosud publikovány čtyři práce, z toho jedno review, pátá publikace je v přípravě.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

11. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GJ-U/02:1

Datum dodání záznamu

30. 6. 2021

Celkové uznané náklady

6 572 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 572 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč