Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 7 (SGA02007GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

203/07/P471

Název projektu anglicky

The study of molecular mechanisms of bacterial adaptation to environmental changes using proteomic techniques

Anotace anglicky

The goal of this study is to explore the effects of three known regulation proteins on Paracoccus denitrificans proteome during adaptation to changed environmental conditions. It is known that these proteins serve as sensors for oxygen and nitrogenous terminal electron acceptors. After construction of the sequence database for mass spectrometry protein identification based on published P. denitrificans genome sequence, a detailed complex proteomic analysis will be performed. The effects of mutation ingenes for regulation proteins on the expression of other proteins in total cell lysates will be examined. The proteins will be separated by two-dimensional gel electrophoresis and identified by mass spectrometry. The proteins with changed expression willbeanalyzed by bioinformatic tools; the functional analyses will be performed for selected proteins. A new chromatographic/mass spectrometric method will be tested for a comparison of membrane fractions protein composition. A created sequence database

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla získána dosud nejkomplexnější mapa proteomu Paracoccus denitrificans. Byly popsány nové regulačních mechanismy v procesu bakteriální adaptace. Metodiky zavedené v rámci projektu nacházejí uplatnění také v dalších oblastech biomedicínského výzkumu. ?

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

22. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-GA0-GP-U/03:3

Datum dodání záznamu

1. 3. 2016

Celkové uznané náklady

1 431 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 431 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč