Studium struktury a exprese genů pro ribozomální RNA v allotetraploidních a jejich rodičovských rostlinných genomech

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 3 (SGA02003GA1PD)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

The structure and the expression of ribosomal RNA genes in allotetraploid and their parental plant genomes

Anotace anglicky

The project will deal with three closely related items: The periodicity and positions of nucleosomes on tandemly repeated 5S rDNA sequences of Nicotiana sylvestris and Nicotiana tomentosiformis will be determined in nucleosomal fractions. The DNAcurvature of 5S rDNA tandem units in N. tomentosiformis will be mapped. The sequence and the structural signals for nucleosome positioning will be searched by comparison of experimental results and predicted models. The effect of cytosine methylation ontranscription of 5S rDNA genes will be verified by "nuclear run-on" in transgenic Nicotiana tabacum. Relative amount of nascent 5S rDNA molecules in control and hypomethylated samples will be expressed as proportion of 5S rDNA and transcript ofnon-methylated transgene signals. Methylation analysis of subrepetitive and promoter regions in IGS (intergenic spacer) sequences of 18S-5.8S-26S rDNA in N. tomentosiformis, N. sylvestris and N. tabacum or alternatively in artificial hybrids of N.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Rodiny 5S rDNA Nicotiana sylvestris (jednotka 430 bp) a Nicotiana tomentosiformis (jednotka645 bp) mají stejnou 180 bp dlouhou periodu rozmístění nukleozómů. Prohledání nukleotidových databází ukázalo, že délky většiny rostlinných 5S rDNA jednotek se liš

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-GA0-GP-U/06:6

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

750 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

750 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč