Využití denaturační gradientové gelové elektroforézy pro studium diverzity mikrobiální populace a degradace organických polutantů v půdě

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Use of denaturing gradient gel electrophoresis in studies of diversity of microbial population and degradation of organic pollutants in the soil

Anotace anglicky

The project is focused on utilization of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) technique in microbial ecology. DGGE is recently developed method allowing identification of bacterial strains on the base of comparing their 16S rDNA sequence withalready known standards. Using this method it is possible to identificate strains contained in soil samples including badly culturable or non-culturable micro organisms. Soil and ground water from the site Chemopetrol Litvínov contaminated with benzene,toluene, ethylbenzene and xylenes (BTEX) will be used as a model together with pristine soil from the same area. The main project objective is characterization of diversity of the microbial population and of its degradation abilities. The spread anddiversity of degradation enzymes will be also studied, and degradation pathways present will be correlated with the content and the concentration of pollutants. A shift of microbial community from pristine to contaminated conditions will be also studied.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EH - Ekologie – společenstva

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V rámci projektu byla optimalizována metoda identifikace bakterií metodou DGGE. Byly vybrány vhodné primery pro PCR amplifikaci části 16S rDNA genů a optimalizovány amplifikační podmínky. Takto amplifikované fragmenty je možné po elektroforetické separac

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-GA0-GP-U/06:6

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

750 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

750 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč