Stanovení genetických markerů vhodných pro diferenciaci bioras Ditylenchus dipsaci pomocí SCAR
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Postdoktorandské granty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 3 (SGA02003GA1PD)
Hlavní účastníci
Česká zemědělská univerzita v Praze / Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Determination of genetic markers for Ditylenchus dipsaci bioraces differentiation by SCAR
Anotace anglicky
General aim of the project is to improve diagnostics of bioraces of quarantine phytophagous stem nematode Ditylenchus dipsaci. A present, accurate, fast and reliable methods of Ditylenchus dipsaci bioraces determination do not exist. Till now thebioracescan be differentiated by the time coming biological tests. Quarantine measures, as the only method of Ditylenchus dipsaci control, are directly dependent on its precise diagnostics. The aim of this project is to find out molecular markers forbiorace discrimination using SCAR (Sequence Characteristic Amplified Region). This method has recently been used for equivalent goals in human and veterinary medicine. SCAR uses random amplification of DNA to find out fragments usable for determination.After selection the fragments are sequenced and decameric primers are elongated so that specifity and reproducibility of results can be guaranteed. Only very small part of Ditylenchus dipsaci genome between S18 and S21 genes 900 bp has been sequenced
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
N - Nesplněno zadání
Zhodnocení výsledků projektu
Během řešení projektu byly získány biorasy D. dipsaci pocházející z mrkve, čekanky a vojtěšky, společně s izoláty z česneku byly použity jako výchozí materiál pro hledání molekulárních markerů pomocí SCAR. Byly optimalizovány protokoly pro izolaci DNA z
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2003
Ukončení řešení
1. 1. 2005
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP06-GA0-GP-U/06:6
Datum dodání záznamu
19. 5. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
744 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
574 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
170 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč