Vliv hydratačního obalu proteinů na stabilitu proteinových komplexů.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 12 (SGA02012GA1PD)

Hlavní účastníci

Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P205-12-P729

Název projektu anglicky

Effect of protein hydration shell on the stability of protein complexes.

Anotace anglicky

Protein-protein interactions are at the basis of almost all cellular processes. The water environment, in which these processes take place, is not a passive medium, but plays an active part in determining the structure and dynamics of both proteins and protein complexes. However, the exact molecular details of water contribution to protein-protein binding are not yet fully understood. Here we propose to take advantage of the latest developments in molecular dynamics models of water and of the wealth of information contained in the large number of X-ray crystal structures of protein complexes to elucidate this question. We propose to investigate the connection between surface properties of both protein monomers taking part in the interaction, water molecule behavior at the protein surface, and the structure and affinity of the resulting protein-protein complex. The insight thus gained will be useful in engineering new artificial binding proteins with applications e.g. as biopharmaceuticals in human medicine.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt se zabývá molekulárním modelováním vybraných struktur proteinů. Výsledky přispějí k detailnějšímu pochopení vlastností hydratačních vrstev proteinů a jsou sumarizovány ve dvou publikacích ve vědeckých časopisech. Řešitelka rovněž vyvinula softwarové nástroje pro analýzu a vizualizaci, která může být aplikována pro studium hydratace jiných biomolekulárních systémů.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

25. 4. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 3. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GP-U/01:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

2 037 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 037 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč