Mechanismus represe translace modelového transkriptu NTP303 během zrání pylu tabáku
Cíle projektu
Posttranskripční kontrola genové exprese hraje zásadní roli při zrání pylu a následném růstu pylové láčky. Pylově specifický gen NTP303 kódující N-glykosylovanou bílkovinu o Mw 69 kDa je integrální složkou buněčné stěny pylové láčky stěny. Silná expresegenu NTP303 začíná již v časných stádiích vývoje pylového zrna, nicméně translace příslušných NTP303 mRNA je kompletně zablokována a tyto transkripty zůstávají uloženy v charakteristických ribonukleoproteinových částicích. Bezprostředně po vyklíčení pyluje iniciována masivní translace NTP303 transkriptů a kódovaný glykoprotein je ukládán ve stěně roztoucí pylové láčky. Cílem našeho projektu je objasnění mechanismu(ů) represe translace NTP303 mRNA během zrání pylu. Naším cílem je využít tento unikátní modelový systém k (i) izolaci bílkovin vázaných na NTP303 mRNAs pravděpodobnou regulační aktivitou, která blokuje její translaci a (ii) prokázat tuto regulační (represivní) funkci. Současně hodláme ověřit možný alternativní/souběžný mechanismus posttranslační inaktivace exprese NTP303 mRNA prostřednictvím mikroRNA, jak již bylo demonstrováno pro jiné geny.
Klíčová slova
pollenmalegametophyteproteomicstranslationregulationmRNPRNA-bindingproteinsmicroRNAs
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Postdoktorandské granty
Veřejná soutěž
Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
P501-11-P321
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Depicting a functional model of NTP303 mRNA translational repression during tobacco pollen maturation
Anotace anglicky
Posttranscriptional control of gene expression plays a vital role during tobacco pollen maturation and pollen tube growth. A pollen-specific gene NTP303 encoding N-glycosylated p69 kDa protein is an essential component of the pollen tube cell wall. The expression of NTP303 gene is detected early at pollen stage 3, however, the encoded mRNAs are translationally repressed and stored within characteristic ribonucleoprotein particles. At the initiation of pollen tube growth, stored NTP303 transcripts are massively translated and the encoded glycoprotein is deposited into the extending pollen tube wall. The aim of our project is to elucidate the mechanism(s) imposed to repress the translation of NTP303 mRNA during pollen maturation. Our objective is to usethis unique model system to (i) isolate regulatory RNA binding protein(s) with a potential repressing activity that could participate in sequestering NTP303 mRNA translation and to demonstrate their function. Simultaneously, (ii) we also intend to investigate using in-depth sequencing approach a possible contribution of microRNAs as an alternative or additional mechanism imposed posttranscriptionally to modulate NTP303 expression during pollen maturation and pollen tube growth.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
ED - Fyziologie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30105 - Physiology (including cytology)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Juniorský projekt přinesl cenné dílčí poznatky o regulaci translace v pylových buňkách. Jeho výsledky byly publikovány ve dvou kvalitních zahraničních vědeckých časopisech, kde byl řešitel vždy prvním autorem.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2011
Ukončení řešení
31. 12. 2013
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
7. 6. 2013
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Datum dodání záznamu
6. 5. 2016
Finance
Celkové uznané náklady
3 034 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 034 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
3 034 tis. Kč
Statní podpora
3 034 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
ED - Fyziologie
Doba řešení
01. 01. 2011 - 31. 12. 2013