Polyploidizace jako klíčový faktor v evoluci genomu bazálních linií obratlovců

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P506-11-P596

Název projektu anglicky

Polyploidization as a key factor in genome evolution of basal vertebrates´ lineages

Anotace anglicky

Double whole genome duplication at the base of vertebrates´ evolution belongs to unexplained issues of the genome evolution. Traces of these events old about 600-640 Myr are obscured by consequent genome reductions and by another rounds of duplication specific to derived groups (e.g. ray-finned fishes). Sturgeons (Acipenseriformes) are the earliest and most ancient group diverged within ray-finned fishes where duplications by means of allopolyploidization take place also nowadays resulting in 3 ploidy levels (4n, 8n, 12 n; the 2n ancestor has not survived). Sturgeons are a unique model system to study genome evolution of early vertebrates with features enabling interspecies hybridisation giving rise to fertile offspring. This project proposes to use sturgeons and their hybrids of the FFPW USB to contribute to elucidation the issue of paleo-ploidy level by undertaking 1) cytogenetics mapping of selected conserved genes (Hox, Sox), 2) testing hypotheses that allopolyploidization is facilitated by nonexistence of sex chromosomes and 3) gene silencing is involved in rediploidisation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EG - Zoologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V průběhu projektu se podařilo úspěšně aplikovat metody genomové in situ hybridizace (GISH) a komparativní genomové hybridizace (CGH) u polyploidních a vysoce polyploidních hybridních ryb. Projekt přinesl čtyři publikace, tři z nich byly publikovány v k?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GP-U/02:2

Datum dodání záznamu

6. 5. 2016

Celkové uznané náklady

2 246 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 246 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč