Hemikatenátové smyčky DNA: jejich výskyt v lidském genomu a rozpoznávání nádorově supresorovým proteinem p53

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA400040702

Název projektu anglicky

Hemicatenated DNA loops: their occurence in humen genome and recognition by tumor suppressor protein p53

Anotace anglicky

Results of mapping of human genome provided evidence that DNA sequences encoding proteins represented only ~3% of human genome. Alternative DNA structures are of particular interest as potential signals to mark important sites on the genome. The CA-microsatelittes are repetitive poly(CA).poly(TG) sequences spread in all eukaryotic genomes. These (and other) sequences can form in vitro a loop maintained at its base by a hemicatenane (hcDNA). hcDNA is specifically recognized and bound by HMGB1 protein which has been implicated in transcription, DNA repair, cell signalling, stimulation of tumor growth and metastasis. We have recently discovered that tumor suppressor protein p53 can bind with high affinity to hcDNA [Štros, M. et al. (2004) Biochemistry 43,7215-7225]. The goal of the project is to search for stable DNA hemicatenanes in human genome and to determine consequences of p53 binding to hcDNA for the functiong of the protein as transactivator of p53-responsive genes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

CEP - další vedlejší obor

FR - Farmakologie a lékárnická chemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30104 - Pharmacology and pharmacy<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla zjištěna schopnost HMGB1 stimulovat katenaci i dekatenaci kruhové DNA za přítomnosti topoizomerázy IIalfa. Byla vypracována metoda přípravy hemikatenanů a zjištěna extrémní afinita HMGB1 a p53 k těmto strukturám DNA.

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2010

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

9. 3. 2010

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP11-AV0-IA-U/02:2

Datum dodání záznamu

28. 6. 2013

Celkové uznané náklady

2 428 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 428 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč