Značení DNA redoxními markery pro elektrochemickou detekci. Aplikace v analýze nukleotidových sekvencí a v molekulární diagnostice.

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA400040901

Název projektu anglicky

DNA labeling with redox markers for electrochemical sensing. Applications in analysis of nucleotide sequences and molecular diagnostics

Anotace anglicky

The aim of this project is the development of novel techniques of DNA labeling and their utilization in DNA electrochemical analysis and biosensor design. The DNA labeling will involve (1) synthesis of nucleoside triphosphate conjugates (modified at nucleobase) with redox-active moieties using aqueous cross-coupling reactions, and (2) their incorporation to DNA by enzymes. Methodology of construction of DNA probes bearing redox markers at specific positions will be developed. Electrochemical features ofthe modified nucleotides and nucleic acids, as well as the influence of DNA structure on electrochemical responses of the conjugate markers, will be studied. Based on these investigations, we will choose labels and analytical procedures suitable for efficient analysis of nucleotide sequences, with emphasis on applications in molecular diagnostics of severe diseases. The labeled nucleic acids will be used in development of novel electrochemical biosensors.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CG - Elektrochemie

CEP - vedlejší obor

CC - Organická chemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10401 - Organic chemistry<br>10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla vypracována metodika redoxního značení DNA založená na syntéze modifikovaných dNTP a jejich enzymatické inkorporaci. Byla optimalizována elektrochemická analýza značené DNA a navrženy nové metody pro analýzu DNA sekvencí a interakcí s proteiny.

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 2. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-AV0-IA-U/01:1

Datum dodání záznamu

14. 4. 2014

Celkové uznané náklady

9 985 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 985 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč