Vývoj elektrochemických biodetektorů pro poškození DNA
Cíle projektu
Navrhujeme vyvinout rychlý, jednoduchý, selektivní a modifikovatelný elektrochemický biodetektor (biosenzor) pro poškození DNA (jak in vitro, tak v buňkách) a pro látky poškozující DNA. Základ tohoto výzkumu bude tvořit metoda vyvinutá v naší laboratořiumožňující detekci zlomů v DNA pomocí rtuťových elektrod modifikovaných nadšroubovicovou DNA. V rámci tohoto projektu bude naše práce zaměřena na následující hlavní témata: (1) Další zdokonalení detekce zlomů v DNA s využitím především stuťových filmových elektrod (MFE), a optimalizace analýzy DNA na MFE. (2) Modifikace dříve vyvinuté metody v techniku umožňující detekci zlomů v eukaryotické chromozomální DNA. (3) Detekce poškození bazí v DNA s využitím enzymů zúčastněných v opravných procesech DNA. Enzymy budou využity jak pro štěpení poškozené DNA v roztoku, tak na povrchu elektrody. (4) Využití výsledků získaných v (1-3) pro analýzu DNA poškozenou in vivo.
Klíčová slova
biosensorbiodetectorelectrochemical detectionDNA damageinteractionsstrand breaksradicalsdrugsmutagenscarcinogensenvironmental pollutants
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
Výzkumné granty 1 (SAV0-AB2001)
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Development of electrochemical biodetectors for DNA damage
Anotace anglicky
It is proposed to develop a fast response, simple, selective and versatile electrochemical biodetector (biosensor) for DNA damage (both in vitro and in cells) and DNA damaging agents. A procedure developed in our laboratory which allows to detect DNA strand breaks using mercury electrodes modified with supercoiled DNA will represent the ground of this research. Within this projects, our efferts will be focused mainly the following topics: (1) Improvement of detection of DNA strand breaks using mainlymercury film electrodes (MFE, and optimization of DNA analysis with the MFE. (2) Modification of the previously developed protocol into a technique allowing sensitive detection of DNA cleavage using eukaryotic chromosomal DNAs. (3) Detection of damage toDNAbases using DNA repair enzymes. The enzymes will be applied both in solution and at the electrode surface. (4) Using the results obtained in (1-3), analysis of DNA damaged in vivo.
Vědní obory
Kategorie VaV
—
CEP - hlavní obor
CG - Elektrochemie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Byly navrženy metody detekce zlomů a poškozených bazí v DNA pomocí rtuťových, filmových a amalgamových elektrod a jejich využití v DNA senzorech. Byly zkoumány vlastnosti DNA modifikovaných osmiem a jejich využití při detekci poškození a hybridizace DNA.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2001
Ukončení řešení
1. 1. 2003
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2004/AV0/AV04IA/U/N/3:2
Datum dodání záznamu
13. 10. 2004
Finance
Celkové uznané náklady
1 758 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
804 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
954 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
1 758 tis. Kč
Statní podpora
804 tis. Kč
45%
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
CEP
CG - Elektrochemie
Doba řešení
01. 01. 2001 - 01. 01. 2003