Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”
IAA4055902

Anomerní D- a L-oligonukleotidy s izopolární, izosterní fosfonátovou internukleotidovou vazbou: Syntéza, hybridizační vlastnosti a spektroskopie

Cíle projektu

Hlavním cílem projektu je 1) studium nových reakcí na cukerném kruhu nukleosidu vedoucím k příslušným fosfonátovým analogům nukleotidů, 2) syntéza odpovídajících oligonukleotidů na pevné fázi a 3) studium základních fyzikálně-chemických a biologických vlastností modifikovaných oligonukleotidů. Detailněji se chemická část projektu zabývá přípravou C-substituovaných geminálních hydroxyfosfonátů a elektrofilní adicí těchto látek na anomerní 4, 5-didehydronukleosidy v D- i L-řadě. Vzniklé 4-C-fosfonomethoxynukleosidy substituované v poloze 5 budou transformovány na vhodně chráněné monomery pro fosfotriesterovou syntézu oligonukleotidů na pevné fázi. Připravené oligonukleotidy budou podrobeny komplexnímu studiu jejich fyzikálně chemických vlastností, zejména jejich hybridizačních schopností ve vztahu k typu fosfonátové vazby, se zřetelem k výběru kandidátů vhodných pro užití jako antisensní oligonukleotidy a aptamery.

Klíčová slova

Phosphonate aligonucleotidesisosteric phosphonatenon-isosteric phosphonateoligonucleotide hybridisationsolid-phase assemblyTm valueRNase Henzyme stabilityNMRRamanMD simulationconformation

Veřejná podpora

  • Poskytovatel

    Akademie věd České republiky

  • Program

    Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

  • Veřejná soutěž

  • Hlavní účastníci

    Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta
    Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

  • Druh soutěže

    VS - Veřejná soutěž

  • Číslo smlouvy

Alternativní jazyk

  • Název projektu anglicky

    Anomeric D- and L-oligonucleotides with isopolar, isosteric internucleotide linkage: Synthesis, hybridization properties and spectroscopy

  • Anotace anglicky

    Project is directed towards synthesis of isopolar, isosteric phosphonate analogs of nucleotides and oligonucleotides based on them which contain enzyme-stable internucleotice bond, attention being paid to some specific properties of oligonucleotides. Main aims are 1)study of new reactions on sugar ring of nucleotide leading to appropriate phosphonate nucleotide analogs, 2)solid-phase synthesis of related oligonucleotides and 3)study of basic physico-chemical and biological properties of modified oligonicleotides. The chemical part deals with the preparation of C-substituted geminal hydroxyphosphonates and their lelctropholic addition to anomeric 4,5-didehydro-nucleosides in both D- and L-series under presence of two different electrophilic agents. 4,5-C-Phosphonomethoxynucleosides substitued in 5-position will be tranformed to suitably protected monomers for phosphotriester solid-phase oligonucleotide synthesis. Obtained oligonucleotides will be subjected to complex investigation.

Vědní obory

  • Kategorie VaV

  • CEP - hlavní obor

    CC - Organická chemie

  • CEP - vedlejší obor

  • CEP - další vedlejší obor

  • OECD FORD - odpovídající obory
    (dle převodníku)

    10401 - Organic chemistry

Hodnocení dokončeného projektu

  • Hodnocení poskytovatelem

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Zhodnocení výsledků projektu

    Byly získány nové izosterní fosfonátové analogy aligothymidylátů. Klíčový vliv 4'-substituentů na hybridizační afinitu byl studován srovnáním s produkty vstřídných syntéz dvou nových typů stálejších oligomerů a fyzikálními metodami (MDS, Raman, NMR).

Termíny řešení

  • Zahájení řešení

    1. 1. 1999

  • Ukončení řešení

    1. 1. 2001

  • Poslední stav řešení

    U - Ukončený projekt

  • Poslední uvolnění podpory

Dodání dat do CEP

  • Důvěrnost údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Systémové označení dodávky dat

    CEP/2002/AV0/AV02IA/U/N/7:3

  • Datum dodání záznamu

    15. 1. 2007

Finance

  • Celkové uznané náklady

    5 127 tis. Kč

  • Výše podpory ze státního rozpočtu

    2 445 tis. Kč

  • Ostatní veřejné zdroje financování

    2 682 tis. Kč

  • Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

    0 tis. Kč

Základní informace

Uznané náklady

5 127 tis. Kč

Statní podpora

2 445 tis. Kč

47%


Poskytovatel

Akademie věd České republiky

CEP

CC - Organická chemie

Doba řešení

01. 01. 1999 - 01. 01. 2001