Evoluce metabolických drah v komplexním plastidu rozsivky Thalassiosira pseudonana

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 5 (SAV02005-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA500220502

Název projektu anglicky

Evolution of metabolic pathways in complex plastid of the diatom Thalassiosira pseudonana

Anotace anglicky

Diatoms possess mutlimembraned complex plastid. Such plastids have evolved during the process of secondary endosymbiosis, when unicellular photosynthetic eukaryote (in the case of diatoms rhodophyte) was engulfed by other unicellular eukaryote. During the evolution, the engulfed endosymbiont was reduced to the form of plastid surrounded by more than two membranes. Most proteins used in such plastid are nuclear-encoded and posttranslationally imported into the complex platid using bipartite targeting presequence. Preliminary analyses of the diatom genome show that plastid metabolic pathways are composed also of enzymes displaying other than expected cyanobacterial (plastid) origin. The project is directed to search for the diatom genes encoding putatively platid-targeted proteins, in silico analysis of their targeting sequences and phylogenetic analyses. In some cases, the 5"-RACE approach will be used to specify 5" - end of transcripts.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

EF - Botanika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl studován původ a lokalizace enzymů tří drah lokalizovaných v komplexním plastidu rozsivek: syntézy hemu, šikimátové dráhy a syntézy tryptofanu. Všechny tyto dráhy vykazují mosaikový charakter: lokalizace enzymů(plastid)neodpovídá jejich původu.

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

1. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 2. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-AV0-IA-U/02:2

Datum dodání záznamu

28. 6. 2013

Celkové uznané náklady

1 264 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 264 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč