Exprese miRNA během časného vývoje drápatky a degradace mRNA

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA500970904

Název projektu anglicky

MicroRNA expression during early development of Xenopus laevis and mRNA degradation

Anotace anglicky

Cells fate and differentiation depend on precise controlled mRNA and protein expression and degradation. Expression of mRNA has been extensively studied, but mechanisms of decay are not known during development. Three different mechanisms of decay have been described: 5'-3' and 3'-5' exonucleolytic cleavage and endonuclease cleavage. In most cases mRNA decay is thought to be stimulated by miRNA. Our goal is to study localization of miRNAs during early development and their role in mRNA decay. Our modelsystem is frog Xenopus laevis, selected because of its huge size of oocytes and the huge number of embryos produced with the same origin. Using the qPCR and in particular the novel qPCR tomography technique that we developed, we will study specific mRNAdecay from the 5'-end, central and from the 3' region of maternal mRNA throughout early developmental stages, where de novo transcription has not yet initiated. Result of our study will be correlated with mRNA degradation postmortem.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla optimalizována metoda detekce degradace mRNA v časném vývoji Xenopus laevis a degradace v tkáních post mortem. Byl navržen RNA spike pro kontrolu RNA degradace vzorků během přípravy a jako marker inhibice reverzní transkripce a qPCR.

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2011

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

18. 3. 2011

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP12-AV0-IA-U/02:2

Datum dodání záznamu

28. 6. 2013

Celkové uznané náklady

2 820 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 820 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč