Epigenetické důsledky dysfunkce telomer u Arabidopsis thaliana

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 3 (SAV02003-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Epigenetic consequences of telomere dysfunction in Arabidopsis thaliana

Anotace anglicky

Telomeres are the natural ends of eukaryotic chromosomes essential for genome stability and cell proliferation. Riha et al. (Texas A&M University) have constructed Arabidopsis mutant knocked-out for telomerace activity. These plants gradually shorten their telomeres and late generations qield aberrant phenotypes eventually leading to developmental arrest. To understand the nature of these defects, we will run histological analysis of shoot apical meristem and expression of corresponding regulatory genes. Since telomeres are sequences usually anchoring chromosomes to nuclear envelope on nucleolus, 3-D in situ hybridization and imminostaining will be performed to analyse chromatin structure in the mutants. Telomere dysfunction can also inflict genetic and epigenetic changes in genome, especially structure of terminal chromatin. Expression and methylation analyses of selected genes localised near the telomeres will be checked in order to look for telomere position (silencing) effect.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

EA - Morfologické obory a cytologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly analyzovány rostliny a z nich odvozené buněčné linie postrádající telomerázovou aktivitu. Zatímco u rostlin docházelo ke vzniku letálního fenotypu, linie kultivované in vitro se podrobovaly rozsáhlým restrukturalizacím genomu umožňující přežití.

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-AV0-IA-U/03:3

Datum dodání záznamu

3. 4. 2009

Celkové uznané náklady

6 361 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 514 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 098 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

749 tis. Kč