Studium indukované reparace DNA u Arabidopsis thaliana

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Inducible DNA repair in Arabidopsis thaliana

Anotace anglicky

Plants protect integrity of their DNA against genotoxic factors by efficient DNA repair. Recently we have shown that the phenomenon of clastogenic (chromosome damage) adaptation to mutagenic treatment depends on thebaseexcision DNA repair. In this pathway are involved polymeraxe beta (Polbeta) and poly(ADP-ribose) polymerace (PARP) that might be also involved in decision mechanism of programmed cell death. We proposed to take advantage of commercial availability to screen T-DNA tagged Arabidopsis linesfor possible knockouts in Polbeta and PARP genes by PCR, because their size quaranties at least 80 % chance of positive hit. Knockout lines will be characterized and tested for changes in sensitivity do DNA damage under various adaptation schedules and by comet assay for the ability to repair DNA damage or induce programmed cell death. We want to answer the question whether these genes preserve the same key roles in DNA repair or whether plants have alternate mechanism.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Studiem 13 knockoutových mutant Arabidopsis v různých reparačních drahách bylo ukázáno, že přednostní a nejúčinější drahou, nezávislou na studovaných mutacích ani tkáni je téměř okamžitá reparace dvojvláknových zlomů DNA.

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-AV0-IA-U/04:2

Datum dodání záznamu

26. 9. 2007

Celkové uznané náklady

3 765 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 814 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 951 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč