Charakterizace rodiny podjednotek Exo70 poutacího komplexu exocyst u Arabidopsis
Cíle projektu
V nedávné době jsme přinesli první důkazy o přítomnosti komplexu exocyst u rostlin (Elias et al. 2003). Tento komplex je známý jako klíčový regulátor cílené exocytosy buněčných váčků u živočichů a hub. Pomocí přístupu in silico jsme předpověděli všech 8podjednotek komplexu exocyst a objevili nevídanou mnohost podjednotek Exo70 v genomech Arabidopsis a rýže. V rámci tohoto projektu chceme studovat možnou vývojově a tkáňově specifickou expresi vybraných zástupců 8 podrodin Exo70 pomocí promotor::GUS fůzív transgenních rostlinách Arabidopsis. Použijeme také transientní a stálou expresi Exo70-GFP fůzí ke studiu jejich diferenciální subcelulární lokalizace a její dynamiky během vývoje a buněčného cyklu pomocí konfokální fluorescenční mikroskopie. Interakce isoforem Exo70 s očekávanými i dosud neznámými partnery budeme studovat pomocí 2-hybridního systému v kvasinkách. Budeme také analyzovat fenotypy mutantů Exo70.
Klíčová slova
exocytosistethering complex exocystExo70localized secretionplant cell morphogenesissmall GTPasesArabidopsisinsertional mutantsGFP localizationconfocal microscopy
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
Výzkumné granty 4 (SAV02004-A)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
IAA6038410
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The characterization of Exo70 subunit family of tethering complex exocyst in Arabidopsis
Anotace anglicky
Recently we provided first evidence for the presence of exocyst complex in plants (Elias et al 2003). This complex is known from animals and fungi to be the key regulator of targeted vesicle exocytosis. Using in silico approach we predicted all 8 exocystsubunits and discovered unprecedented multiplicity of plant Exo70 exocyst subunits within Arabidopsis and rice genomes. In this project we will pursue possible developmental- and tissue-specific expression of selected representatives of 8 Exo70 subfamilies using promoter::GUS fusions in trangenic Arabidopsis plants. We will also use transient as well as stable expression of Exo70-GFP fusions to study their different subcellular localization and its dynamics within the development and the cell cycle using confocal fluorescence microscopy. Interactions of Exo70s isoforms with predicted as well as yet unknown proteins will be studied using 2-hybrid system in yeast. Phenotypes of Exo70 mutants will be also analysed.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EA - Morfologické obory a cytologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Ukázali jsme, že také u rostlin jsou přítomny podjednotky exocystu a jsou aktivní v regulaci buněčné morfogeneze. Analýza mnohočetných podjednotek Exo70 ukázala na možnou souvislost s evolucí tvaru. Pokročili jsme směrem k analýze celého komplexu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2004
Ukončení řešení
1. 12. 2007
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
27. 2. 2007
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP08-AV0-IA-U/02:2
Datum dodání záznamu
28. 6. 2013
Finance
Celkové uznané náklady
9 555 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 695 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
5 860 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
9 555 tis. Kč
Statní podpora
3 695 tis. Kč
38%
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
CEP
EA - Morfologické obory a cytologie
Doba řešení
01. 01. 2004 - 01. 12. 2007