Počítačové simulace slabých polyelektrolytů pomocí molekulové dynamiky
Cíle projektu
Cílem projektu je studium slabých polyelektrolytů (PE) pomocí molekulové dynamiky (MD). Slabé PE mají specifické vlastnosti a mnoho aplikací v průmyslu a technologii. Jsou také nedílnou součástí biologických systémů, protože mezi ně patří většina proteinů. Na rozdíl od silných PE, slabé PE jsou schopny reverzibilní disociace, což způsobuje pohyblivost nábojů na polymerním řetězci. Současné metody MD neobsahují nástroj na simulaci slabých PE, protože pohyblivost nábojů je komplikace, která zatím nebyla vyřešena. V rámci našeho projektu chceme vyvinout jednoduchý fenomenologický model, který zahrne pohyblivost nábojů na řetězcích slabých PE. Dále budeme studovat vliv pohyblivosti nábojů na vlastnosti slabých PE. Později vytvoříme sofistikovanější model disociace a vykonáme simulace pomocí tohoto modelu. Tímto způsobem budou poprvé v MD simulaci zahrnuty specifické vlastnosti slabých PE.
Klíčová slova
polyelectrolytessimulationmolecular dynamicsweak polyelectrolytesSCFMonte Carlorate of dissociationchain transfer
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Juniorské badatelské grantové projekty
Veřejná soutěž
Juniorské badatelské grantové projekty 5 (SAV02007-B)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
KJB401110701
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Molecular Dynamics Simulations of Annealed Polyelectrolytes
Anotace anglicky
The aim of the project is to study weak polyelectrolytes (PEs) using molecular dynamics (MD) simulations. Weak PEs have peculiar properties and many applications in industry and technology. They are an essential part of biological systems, since most proteins are weak PEs. Unlike strong PEs, the weak ones are capable of reversible dissociation and hence the charges on them are mobile. Current MD methods do not provide a tool for simulating weak PEs because the mobility of charges is a complication whichhas not been overcome yet. Within our project a simple phenomenological model will be developed which will account for the mobility of charges in weak PEs. Next the effect of the mobility of charges on the properties of the PE will be studied. Later thedissociation will be treated in a more sophisticated manner and simulations using the more sophisticated model will be performed. Thus for the first time the essential characteristics of weak PEs will be accounted for in an MD simulation
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CD - Makromolekulární chemie
CEP - vedlejší obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10403 - Physical chemistry
10404 - Polymer science
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Publikován jeden článek s výsledky simulací; druhý je v připravě. Jeden související článek přijat k publikaci. Odeslány jeden přehledový článek zčásti obsahující výsledky projektu a jeden úzce související článek. Další dva související články v přípravě.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2007
Ukončení řešení
31. 12. 2009
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
28. 4. 2009
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP10-AV0-KJ-U/03:3
Datum dodání záznamu
14. 6. 2011
Finance
Celkové uznané náklady
998 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
998 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
998 tis. Kč
Statní podpora
998 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
CEP
CD - Makromolekulární chemie
Doba řešení
01. 01. 2007 - 31. 12. 2009