Celogenomová analýza sítě transkripčních faktorů účastnících se regulace vývoje samčího gametofytu Arabidopsis thaliana

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 2 (SAV02004-J)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Genome-wide analysis of male gametophyte transcription factor network in Arabidopsis thaliana

Anotace anglicky

Sexual reproduction of flowering plants requires highly specialised structure of male gametophyte, pollen grain. We have a very limited understanding of the regulatory mechanisms that have evolved to specify the gametophytic developmental programme and ensure its flawless progress at the level of cell differentiation. Different expression profiles of genes active during pollen development and germination suggest the existence of specific mechanisms of regulation of pollen gene expression. Objectives ofthis project are 1) to generate and make publicly available the database of gametophytic transcription factors including their expression data; 2) after application of described selection criteria, to perform functional analysis of selected factors and 3) for two selected transcription factors (one early- and one late-acting; both with demonstrated biological function) to unravel networks of regulated genes (regulons) using ectopic overexpression folowed by the microarray analysis.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly popsány transkripční faktory (TF) aktivní v samčím gametofytu huseníčku a byla zpřístupněna databáze transkriptomických dat arabidopsisGFP. Byly funkčně charakterizovány inserční mutanty v genech pro TF a dva geny byly použity pro čipový experiment.

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-AV0-KJ-U/02:2

Datum dodání záznamu

3. 4. 2009

Celkové uznané náklady

8 912 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 783 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

6 129 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč