Sekvenování genů transkriptů slinných žláz krevsající ploštice Triatoma infestans metodou ?next-generation? za účelem výzkumu markerů expozice
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
KONTAKT II
Veřejná soutěž
KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-6805/2013-311
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Next-generation sequencing of salivary gland gene transcripts of Triatoma infestans for the discovery of triatomine exposure markers
Anotace anglicky
This project aims to employ for the first time next-generation sequencing to study the salivary gland transcriptome dynamics of T. infestans, the most important vector of Chagas disease. 454 and Illumina sequencing will identify genes expressed during the entire life cycle of T. infestans. These novel sequencing techniques will allow fast, efficient and high throughput sequencing at lower cost in comparison with previous methodologies. Our modern and holistic experimental approach will describe transcripts of different triatomine strains and genes expressed at different time points after a blood meal of a given developmental stage. This new dataset of salivary gland ESTs will be the basis for the development of novel T. infestans exposure markers to detect low level infestation of triatomines. These markers will be a valuable tool for Chagas disease control, especially for vector surveillance in former endemic Chagas disease areas at an early stage after vector control measures have been implemented.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Pro experimentální sání a pitvu slinných žlaz byly použity bolívíjské kmeny T. infestan, byla izolována celková RNAa sekvenována v systému Illuminia. Reakcí s morčecími séry byl 35 kDa protein slin T. infestansidentifikován jako kandidátní marker expozi?
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 3. 2012
Ukončení řešení
31. 12. 2014
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
11. 4. 2013
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP15-MSM-LH-U/01:1
Datum dodání záznamu
2. 7. 2015
Finance
Celkové uznané náklady
2 666 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 666 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč