Role alternativního sestřihu mRNA v evoluci stavby těla obratlovců

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

KONTAKT II

Veřejná soutěž

KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-6805/2013-311

Název projektu anglicky

The role of alternative splicing in evolution of vertebrate body plan

Anotace anglicky

Our goal is to elucidate the genetic mechanism that shape the vertebrate body plan by using the basal chordate amphioxus (Cephalochordata)as a structurally and genomically simple model. The more complex body plan of vertebrates compared to that of amphioxus is thought to be largely due to gene duplications. However the role of more extensive alternative splicing leading to a more complex genetic toolkit has not been investigated. Project aims to perform a comprehensive evolutionary analysis of alternative splicing in Pax gene family. We will determine the degree of conservation of Pax splice forms within cephalochordates, compare alternative splicing between cephalochordates, tunicates and vertebrates, determine expression of alternative transcripts and perform functional analysis of alternatively spliced transcripts.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

"Projekt čtyřleté mezinárodní spolupráce mezi laboratoří dr. Zbyňka Kozmika (UMG AVČR v.v.i.) a dr. Lindy Holland (Scripps Institution of Oceanography) byl zaměřen na studium evoluční konzervace alternativního sestřihu mRNA u rodiny genů Pax. Výsledkem projektu jsou k datu ukončení podpory v roce 2015 tři publikace s dedikací na projekt v mezinárodních recenzovaných odborných časopisech."

Zahájení řešení

1. 3. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 2. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-MSM-LH-U/01:1

Datum dodání záznamu

9. 10. 2017

Celkové uznané náklady

2 885 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 885 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč