Posttranskripční úpravy tRNA u trypanosomy spavičné

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

KONTAKT II

Veřejná soutěž

KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)

Hlavní účastníci

Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-6805/2013-311

Název projektu anglicky

Posttranscriptional modifications of tRNAs in Trypanosoma brucei

Anotace anglicky

One of the striking features of tRNAs is their numerous post-transcriptional modifications. A large number of enzymes required for different modifications have now been identified in many model organisms, but despite some progress little is known about modification enzymes in Trypanosoma brucei, an evolutionarily divergent and medically very important protist. Some tRNA modification enzymes target the anticodon loop of various tRNAs and can impact cytoplasmic and mitochondrial protein synthesis. Importantly, several of them either need iron-sulfur (Fe-S) cluster or use components of the Fe-S cluster assembly pathway for their activity. The proposed aim of this project is to study tRNA modifications such as thiolation, methylation and wybutosine formation in T. brucei. Our objective is to determine their subcellular localization and their biological roles in the given compartment. The obtained results will elucidate different tRNA maturation pathways and their dependence on Fe-S clusters.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly studovány geny účastnící se tvorby tRNA modifikací (metylace a thiolace) bazí a železo-sirných center u Trypanosomy brucei. Ukázalo se, že ABCB transportér Atm1, klíčový gen tvorby Fe-S center, mají vliv také na cytosolickou thiolaci tRNA, naproti tomu další ABCB transportér Mdl nehraje roli ani v jednom se zmiňovaných procesů, ale má roli v udržování homeostáze hemu v buňce. Dále jsme studovaly přídatných faktory pro biogenezi ribosomu u trypanosomy. Jedním z nich je methyltransferáza TbMTase37, která je lokalizována v jadérku a její vypnutí vede ke sníženému počtu polysomů v buňce a následně ke snížené translaci.

Zahájení řešení

1. 3. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

27. 2. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-MSM-LH-U/01:1

Datum dodání záznamu

9. 10. 2017

Celkové uznané náklady

3 988 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 648 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

340 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč