Funkční genomika dvoudomých rostlin

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

KONTAKT II

Veřejná soutěž

KONTAKT II 4 (SMSM2014LH4)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-9919/2014-1

Název projektu anglicky

Functional Genomics of Dioecious Plants

Anotace anglicky

Techniques of massive sequencing have recently enabled to identify thousands of genes in various organisms. However, their functional validation remains rather complicated especially in organisms, in which techniques of genetic transformation and/or targeted mutagenesis are not feasible. In model dioecious plants ? white campion (Silene latifolia) and sorrel (Rumex acetosa) ? possessing evolutionary young sex chromosomes first sex-linked genes have been recently found. These genes are important clues tosolve the complex process of sex separation and evolution of sex chromosomes. The project is focused on identification and functional analysis of sex-linked genes and genes with sex-specific expression. An efficient method enabling targeted mutagenesisand silencing of sex-linked genes will be developed. Selected sex-linked genes will be switched-off and their phenotype studied. This project has already been started as a result of successful collaboration between the laboratory of the Czech applicant and the American partner that belongs among the world-class pioneers of targeted mutagenesis in plants and other organisms.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

EI - Biotechnologie a bionika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V třetím roce projektu došlo k propojení poznatků získaných v předešlých fázích projektu. Díky nedávnému vypracování transformačního protokolu byly konstrukty CRISPR/Cas9 vneseny do rostlin a izolovány mutace v genu AP3. Dále byly úspěšně otestovány možnosti využití amiRNA a gene targetingu u S. latifolia. V posledním roce projektu byla uskutečněna již čtvrtá stáž do laboratoře zahraničního partnera. Za celkovou dobu trvání projektu byly publikovány 4 práce v prestižních časopisech (BMC Genomics, Genome Biology a Nature Plants).

Zahájení řešení

1. 4. 2014

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

18. 2. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-MSM-LH-U/01:1

Datum dodání záznamu

23. 6. 2017

Celkové uznané náklady

4 557 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 780 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 777 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč