Identifikace proteinů asociovaných s genotoxickými RNA:DNA hybridy a studium jejich úlohy v udržení genomové stability
Cíle projektu
Cílem tohoto projektu je vyvinout metodu pro izolaci proteinových komplexů asociovaných s RNA:DNA hybridy, identifikovat proteiny přítomné v těchto komplexech za podmínek vedoucích k interferenci mezi replikací a transkripcí a ověřit zda jsou potřebné kudržení genomové stability.
Klíčová slova
R-loopsRNA:DNA hybridtranscription/replication collisionreplication stressgenomic instability
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
KONTAKT II
Veřejná soutěž
KONTAKT II 4 (SMSM2014LH4)
Hlavní účastníci
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-9919/2014-1
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Identification of protein complexes associated with genotoxic RNA:DNA hybrids and their role in maintenance of genomic stability
Anotace anglicky
The aim of this project is to prepare tools for the isolation of proteins associated with R-loops, identify proteins associated with these structures under different conditions promoting transcription/replication collision and R-loop formation and validate their role in maintenance of genomic stability.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
FD - Onkologie a hematologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30204 - Oncology
30205 - Hematology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Kolize mezi replikačními a transkripčními komplexy jsou zdrojem replikačního stresu, který významně přispívá k rozvoji rakoviny. Popsali jsme mechanismus, jakým se DNA helikáza RECQ5 podílí na řešení těchto kolizí a na udržení genomové stability. Vyvinuli jsme novou metodu pro detekci a izolaci genotoxických struktur tzv. R-smyček a identifikovali místa jejich tvorby za podmínek replikačního stresu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
11. 4. 2014
Ukončení řešení
31. 12. 2016
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
18. 2. 2016
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-MSM-LH-U/01:1
Datum dodání záznamu
23. 6. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
1 823 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 823 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
1 823 tis. Kč
Statní podpora
1 823 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
11. 04. 2014 - 31. 12. 2016