Identifikace nových kauzativních genů pomocí funkčních studií u vybraných mendelovských chorob
Cíle projektu
Projekt je založen na komplementární expertíze dvou kooperujících partnerů a jeho hlavním cílem je nalezení funkce a úlohy identifikovaných genů a jejich mutací ve vybraných mendelovských chorobách. Geny a jejich mutace u vysoké myopie, dědičné hypermuscularitě, Melkersson-Rosenthal syndromu, mendelovské epilepsii, cerebelární hypoplasii a SCAD (short-chain Acyl-CoA dehydrogenase deficience) byly identifikovány a nadále jsou studovány čínským partnerem z Beijing Genome Institute (BGI), který je etablovaným expertem v sekvenačních a bioinformačních technologiích. Úlohou našeho pracoviště (laboratoř R. Sedláčka v rámci Českého centra fenogenomiky; http://www.phenogenomics.cz/; ÚMG, projekt BIOCEV), které má know-how v přípravě transgenních myších modelů,je připravit myší transgenní modely s danou mutací k ověření úlohy mutovaného genu. Projekt začne nejdříve s přípravou a analýzou modelu pro nalezení identifikované mutace pro ?zinc finger protein 644 isoformu 1? (ZNF644), na jehož identifikaci se kooperující partner podílel. Bodová mutace S672G v genu ZNF644 (u myši je označení Zfp644, vysoká homologie) byla identifikována pomocí exonového sekvenování v pacientech s vysokou myopií. Význam zmíněného genu je z biologicko-fyziologického i molekulárního hlediska neznámý, stejně tak jako jeho mutace.
Klíčová slova
transcription activator-like effector nucleases (TALEN)transgenic modelmendelian diseasemutation
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
KONTAKT II
Veřejná soutěž
KONTAKT II 4 (SMSM2014LH4)
Hlavní účastníci
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-9919/2014-1
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Novel Causative Genes Identification and Functional Study for selected Mendelian Disorders
Anotace anglicky
The overall goal of the project is to reveal the role of candidate-genes and their mutations identified in patients suffering from selected Mendelian disorders. The project has several sub-aims: 1/ to describe the role of the candidate-gene transgenic mouse model for functional ablation of Zfp644 gene (ZNF644 in human) will be generated as well as mutants containing the 672G mutation, which is appearing in the patients with high myopia, 2/ the both transgenic models will be phenotyped to reveal their biological role, 3/ the impact of the gene ablation and S672G mutation will be studied in the context of vision, and 4/ additional transgenic models for Melkersson-Rosenthal syndrome, Inherited hypermuscularity, Mendelian Epilepsy, Cerebellar hypoplasia, SCAD deficiency ( short-chain Acyl-CoA dehydrogenase) will be generated. TALEN technology will be used to reveal the impact of the functional gene ablation and the role of specific mutations.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
ED - Fyziologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30105 - Physiology (including cytology)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Mutace v genu kodující transkripční faktor ZNF644 byla identifikována u lidí ze silnou krátkozrakostí. Laboratoř vytvořila trasgenní model replikující tuto mutaci, aby ověřila původní hypotézu. Kromě transgenního modelu s mutací byl vytvořen také model, který tento transkripční faktor nemá. Z charakterizace tohoto modelu vyplynulo, že gen ovlivňuje spermatogenezi i růst organismu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 4. 2014
Ukončení řešení
31. 12. 2016
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
18. 2. 2016
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-MSM-LH-U/01:1
Datum dodání záznamu
23. 6. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
4 566 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 450 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
3 116 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 566 tis. Kč
Statní podpora
1 450 tis. Kč
31%
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 04. 2014 - 31. 12. 2016