Studium siRNA populací virových a transgenních transkriptů související s rezistencí na transgenní švestky v interakci s virem šarky švestky
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
KONTAKT II
Veřejná soutěž
KONTAKT II 5 (SMSM2015LH5)
Hlavní účastníci
Národní centrum zemědělského a potravinářského výzkumu, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT- 32267/2015-1
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Study of siRNA populations of viral and transgenic transcripts associated with resistance in transgenic plum in interaction with Plum pox virus
Anotace anglicky
The aim of the proposed project is to determine of the stability field growing C5 resistance to permanent Plum pox virus pressure through quantitative analysis of virus titre by RT-qPCR, to develop "Next generation sequencing" based technology for the analysis of siRNAs of viral and transgenic transcript and to assess the role of small RNA transcriptome in RNA silencing and stability of resistance in transgenic plum carrying transgenic transcript, coat protein gene of Plum pox virus.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Výsledek projektu prokázal stabilitu rezistence transgenní švestky HoneySweet proti viru šarky švestky (PPV)pomoci analýzy titru viru prováděním RT-Qpcr a analýzou malých RNA pomocí sekvencování nové generace (NGS). Nízká úroveň titru viru a vysoká abundance indukce 21nt, 22nt a 24nt siRNA (vsRNA) prokázaly rezistenci založenou na umlčení genu-RNAsilencing i v případě silného infekčního tlaku viru.
Termíny řešení
Zahájení řešení
14. 10. 2015
Ukončení řešení
31. 12. 2017
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
2. 3. 2017
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP18-MSM-LH-U/01:1
Datum dodání záznamu
7. 6. 2018
Finance
Celkové uznané náklady
1 740 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 740 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč