Genetická analýza mitochondriálního proteomu: Integrace mitochondriální-jaderné epistáze s patofyziologickými fenotypy u potkana

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

ERC CZ

Veřejná soutěž

ERC CZ 1 (SMSM2012LL1)

Hlavní účastníci

Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

LL1204

Název projektu anglicky

Genetic analysis of mitochondrial proteome: Integration of mitochondrial-nuclear epistasis with disease phenotypes in the rat

Anotace anglicky

Mitochondria accommodate a number of key metabolic pathways. Mitochondrial dysfunction is recognised as an important determinant of a variety of human pathologies, ranging from oxidative phosphorylation disorders to common complex diseases. The mammalian mitochondrial proteome is uniquely encoded by two genomes – nuclear and mitochondrial (mtDNA). While mtDNA encodes only 13 proteins, it is estimated that another ~1,500 nuclear (mitonuclear) genes code for mitochondrial proteins. So far only ~1,100 proteins have clearly ascribed mitochondrial localisation but ~300 of them have no known function and the functions of another ~300 are based only on sequence similarity. This proposal is designed as the first systematic effort to genetically dissect the role of mitochondrial proteins in the pathogenesis of mitochondrial dysfunction and cardiometabolic disorders in the most widely used animal model of metabolic syndrome, the spontaneously hypertensive rat (SHR). This will be accomplished by large scale genetic and network analyses of the mitochondrial proteome and the mitonuclear and mtDNA transcriptomes together with mitochondrial function phenotypes and cardiometabolic traits in recombinant inbred (RI) strains derived from the SHR and the normotensive Brown Norway (BN-Lx) rat. These studies will identify high priority candidate gene variants involved in the regulation of both mitochondrial function and disease related phenotypes. Variants of mitonuclear genes prioritised by the above mentioned analyses will be directly tested by in vivo functional studies using transposon-based transgenesis or zinc finger nuclease knock out techniques as appropriate. Proposed studies will enable the identification of genetic determinants of the mitochondrial proteome in relation to important complex disease traits in the rat and thereby improve understanding the role of mitochondria in pathogenesis of common clinical disorders.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

ED - Fyziologie

CEP - další vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Posláním projektu bylo studium genů kódujících mitochondriální proteiny pomocí celogenomových vazebných analýz, odhalení nových kandidátních mitoproteinů a jejich charakterizace. U řady genů se během projektu podařilo provést jejich funkční charakterizaci (Tmem70, Usmg5) u jiných pak odhalit zcela nové funkce (Wars2). Výsledky byly publikovány v celkem 40 publikacích v časopisech s impakt faktorem.

Zahájení řešení

1. 7. 2012

Ukončení řešení

30. 6. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

30. 1. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-MSM-LL-U/01:1

Datum dodání záznamu

10. 5. 2018

Celkové uznané náklady

46 094 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

46 094 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč