Komunikace mezi transkripcí a translací

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

ERC CZ

Veřejná soutěž

SMSM2020LL002

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-19250/2020

Název projektu anglicky

Crosstalk between transcription and translation

Anotace anglicky

In Bacteria and Archaea, newly transcribed RNAs are immediately bound by ribosomes, thus coupling transcription to translation. Indeed, recent cryo-electron microscopy (cryo-EM) studies report that RNA polymerase and ribosome may interact directly. This contrasts with eukaryotic transcription and translation which are physically separated by the nuclear envelope. Nevertheless, some double-strand DNA viruses replicate in cytoplasmic factories of infected eukaryotic cells, raising the possibility that viral transcription might be directly coupled to translation by host ribosomes in vivo. I propose to unravel the fundamental mechanism of the transcription-translation coupling in bacteria and to test the hypothesis that replication of cytoplasmic viruses in eukaryotic cells requires coupled transcription and translation. To understand the mechanism of transcription-translation coupling in bacteria, we will characterize the compositions of coupled transcription-translation complexes, and visualize the structures of complexes using cryo-EM. The state-of-the-art timeresolved cryo-EM studies will allow us to capture transient structural intermediates of bacterial RNA polymerase and ribosome during transcription-translation coupling. These studies will significantly improve the current understanding of gene regulation in bacterial cells and may point to stress responses in eukaryotes that will challenge the long-standing dogma of functional separation of transcription and translation. To investigate transcription-translation coupling of viruses in eukaryotic cells, we will use cryo-electron tomography to visualize the in situ arrangement of ribosomes in viral factories in infected cells. Our biochemical and structural analysis of coupled transcription and translation between the pathogen and host will open the way to new pharmacological approaches to inhibiting viral infections.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 7. 2020

Ukončení řešení

30. 6. 2025

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

10. 1. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MSM-LL-R

Datum dodání záznamu

19. 2. 2024

Celkové uznané náklady

48 953 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

48 953 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč