Vysoce přesný systém digitální polymerázové řetězové reakce pro detekci cfDNA pro neinvazivní prenatální testování (NIPT

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INTER-EXCELLENCE

Veřejná soutěž

INTER-EXCELLENCE 20 (SMSM2019LTACH)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-268/2019-5

Název projektu anglicky

High Precision Digital PCR for cfDNA Detection in Noninvasive Prenatal Testing (NIPT) Applications

Anotace anglicky

In frame of this collaborative project we will develop a system to perform economical noninvasive diagnoses of prenatal gene defects. We will use highly specific digital polymerase chain reaction (dPCR) with a multiplexing using melting curve analysis principle for multi gene detection. We will build and optimize the mathematical model of dPCR with high number of reaction wells up to 20 million.We will also develop a fast dPCR system by optimization of the hardware and fast heat transfer from the thermoelectric heater/cooler to the dPCR chip. We will optimize the technology with regard to its use in non-invasive prenatal testing based on examination of circulating fetal DNA in maternal plasma.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

FS - Lékařská zařízení, přístroje a vybavení

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla vyvinuta unikátní metoda duplexování (detekce dvou různých typů sekvencí) na platformě dPCR za využití jediného kanálu pro detekci fluorescence. Metoda využívá kombinace interkalačního barviva EvaGreen a sondy značené FAM. Byl zkonstruován miniaturizovaný přenosný systém pro dPCR dovolující přesnou kvantifikaci obou cílových sekvencí nutnou pro neinvazivní prenatální diagnostiku.

Zahájení řešení

1. 6. 2019

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 3. 2021

Důvěrnost údajů

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Systémové označení dodávky dat

CEP22-MSM-LT-U

Datum dodání záznamu

1. 7. 2022

Celkové uznané náklady

30 381 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

20 397 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

9 984 tis. Kč