Proteomická inventarizace membránových proteinů lidských neuroendokrinních nádorů feochromocytomu a paragangliomu jako cesta k inovaci diagnostických a terapeutických přístupů
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
INTER-EXCELLENCE
Veřejná soutěž
INTER-EXCELLENCE 1 (SMSM2016LTA01)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-16988/2017-1
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Proteomic inventarization of integral membrane proteins in human pheochromocytoma and paraganglioma - paving the way towards novel diagnostic and therapeutic approaches.
Anotace anglicky
The aim of the project is to describe the complete set of integral membrane proteins (membrane proteome) of human pheochromocytoma and paraganglioma and their subtypes. The knowledge of the membrane proteome will pave the way toward identification of new therapeutic targets (druggable taregts and epitopes for therapeutic antibodies) for the therapy of metastatic pheochromocytoma and paraganglioma. In addition, the proteomci analysis will identify the proteins which may be used as biomarkers tp assist sub-classification of the diseases, prediction of metastasis and monitoring of the disease in clinical setting.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
FD - Onkologie a hematologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
CE - Biochemie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Byla vyvinuta nová strategie „Pitchfork“ kombinující 4 metody analýzy membránových proteinů, která umožňuje detailní popis membránového proteomu. Tímto postupem bylo analyzováno 14 pacientských vzorků feochromocytomu a paragangliomu. V každém vzorku bylo identifikováno cca 1000-1200 membránových proteinů. Souhrnný dataset zahrnuje cca 2500 integrálních membránových proteinů exprimovaných v pacientských vzorcích.
Termíny řešení
Zahájení řešení
17. 5. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2019
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
19. 2. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP20-MSM-LT-U/01:2
Datum dodání záznamu
8. 6. 2020
Finance
Celkové uznané náklady
2 455 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 455 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč