Metabolomika 2.0: Komplexní analytické metody a bioinformatické nástroje pro studium cirkadiánních rytmů

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INTER-EXCELLENCE

Veřejná soutěž

SMSM2019LTA01

Hlavní účastníci

Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-37785/2019-2

Název projektu anglicky

Metabolomics 2.0: Comprehensive analytical methods and bioinformatics tools for the study of circadian rhythms

Anotace anglicky

The aim of this project is to establish cooperation and active scientific activity between the Laboratory of Translational Metabolism, Laboratory of Metabolomics and Laboratory of Biological Rhythms (Institute of Physiology of the Czech Academy of Sciences) and the West Coast Metabolomics Center (University of California, Davis). The project focuses on the development of complex analytical methods and bioinformatics tools for the study of circadian rhythms. Recent improvements in chromatography and mass spectrometry methods, together with huge advances in computational approaches, means the time is right to develop second-generation metabolomics tools (Metabolomics 2.0) for the study of circadian rhythms. Scientific publications with detailed information needed for effective transfer of the methods will be available for other research institutions focusing on similar topics.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology

OECD FORD - vedlejší obor

10406 - Analytical chemistry

OECD FORD - další vedlejší obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

AF - Dokumentace, knihovnictví, práce s informacemi<br>BC - Teorie a systémy řízení<br>BD - Teorie informace<br>CB - Analytická chemie, separace<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>IN - Informatika

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V roce 2022 jsme provedli LC-MS metabolomickou analýzu plazmy a tkání potkana. Pokračovali jsme v analýze standardů pomocí LC-MS za účelem tvorby spektrální knihovny. Vytvořili jsme databázi (webová aplikace) z výsledků omics analýz. Řešitel spolupracoval na online kurzu International Summer Sessions in Metabolomics a navštívil amerického partnera.

Zahájení řešení

1. 1. 2020

Ukončení řešení

31. 12. 2022

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 3. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-MSM-LT-U

Datum dodání záznamu

30. 6. 2023

Celkové uznané náklady

7 740 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 740 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč