Mapování diversity živočišných genomů za využití místních zdrojů dostupných v České republice

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

INTER-EXCELLENCE

Veřejná soutěž

INTER-EXCELLENCE 13 (SMSM2018LTC01)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

LTC18060: MSMT-16506/2018-35

Název projektu anglicky

Mapping of diversity in avian genomic resources available in the Czech Republic

Anotace anglicky

The main goal of this project is to develop a methodological and material basis for animal genome annotation through description of diversity in avian genetic resources in the Czech Republic (domestic as well as free-living). The project is based on international collaboration and knowledge-transfer within the FAANG-Europe community and contributes to the development of European genomic resources awareness in general (open data). The aims are divided into three sub-tasks: 1) To develop the national collection of avian genomic samples (under ZCU genetic bank). 2) To create a new collection of RNA samples available for transcriptomic research. 3) To describe in selected genetic resources represented in these collections expression and sequence transcriptome variation using modern methods of RNA-seq and WTTS-seq in collaboration with international FAANG partners.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

40203 - Husbandry

OECD FORD - vedlejší obor

10613 - Zoology

OECD FORD - další vedlejší obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EG - Zoologie<br>GI - Šlechtění a plemenářství hospodářských zvířat

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Ve druhé polovině roku 2018 proběhla inicializační fáze projektu: rozvoj kolekce vzorků genetických zdrojů a revizi postupů pro biobanking. Kolekce genomických vzorků čítá 7327 databázovaných položek (ZCU). Ve spolupráci se zahraničními partnery projektu byly již nyní získány první publikační výstupy (Świderská et al. 2018, Bílková et al. 2018), které byly plánovány až na druhou etapu projektu.

Zahájení řešení

1. 8. 2018

Ukončení řešení

12. 4. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

24. 2. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-MSM-LT-U/01:1

Datum dodání záznamu

15. 6. 2021

Celkové uznané náklady

1 922 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 922 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč