Proteomická charakterizace povrchových membránových proteinů, sekretomu a exosomů lidského buněčného modelu Huntingtonovy choroby.
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
INTER-EXCELLENCE
Veřejná soutěž
INTER-EXCELLENCE 13 (SMSM2018LTC01)
Hlavní účastníci
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-16506-/2018-50
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Proteomic characterization of cell membrane surface proteins, secretome and exosomes in human cell based Huntington’s disease model.
Anotace anglicky
The proposed project aims to analyze the changes in composition of cell surface and secreted proteins of neural stem cells (NSCs) in the presence of mutant huntingtin (mHTT) protein and also changes in proteome and miRNA composition of exosomes secreted by these cells. This will bring new knowledge about developmental changes caused by the presence of mHTT and will contribute to better understanding of cell autonomous and intercellular mechanisms of HD pathogenesis. Specific Aim 1: Characterization of cell surface proteins of control and HD NSCs using cell surface capture technology combined with LC-MS analysis. Specific Aim 2: Analysis of secreted growth factors, cytokines and chemokines in culture medium of control and HD NSCs. Specific Aim 3: LC-MS based proteomic analysis of exosomes secreted by control and HD NSCs. Specific Aim 4: Analysis of miRNA composition of exosomes secreted by control and HD NSCs.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30103 - Neurosciences (including psychophysiology)
OECD FORD - vedlejší obor
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - další vedlejší obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>FH - Neurologie, neurochirurgie, neurovědy
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rámci projektu jsme vyvinuli multiplexní metodika stanovení biomarkerů diferenciace nervových buněk pomocí SRM hmotností spektrometrie (Suchá et al. 2021). Dále byly popsány změny v sekretomu a proteomu nervových buněk během neurální diferenciace in vitro (Červenka et al. 2020). Zjištěné mechanismy regulace diferenciace v kontrolních NSC poslouží jako základ pro srovnání se změnami v proteinové expresi v buňkách nesoucích mutovaný huntingtin.
Termíny řešení
Zahájení řešení
20. 5. 2018
Ukončení řešení
15. 9. 2021
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
9. 3. 2021
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-MSM-LT-U
Datum dodání záznamu
29. 6. 2022
Finance
Celkové uznané náklady
5 309 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
4 525 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
784 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč